Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms