Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBOF1Q8ND07 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms