Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms