Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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