Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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