Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms