Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms