Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms