Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms