Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASPRV1Q53RT3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASPRV1Q53RT3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms