Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms