Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP24-1Q3LI83 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms