Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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