Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ETFDHQ16134 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms