Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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