Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms