Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITSN1Q15811 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms