Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIP10Q15642 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms