Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NR1D2Q14995 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms