Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms