Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP1A4Q13733 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms