Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms