Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms