Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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