Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CHAF1BQ13112 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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