Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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