Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TROQ12816 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TROQ12816 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TROQ12816 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TROQ12816 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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