Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EP300Q09472 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EP300Q09472 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms