Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms