Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms