Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms