Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEX3Q00994 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms