Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5Q00535 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms