Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX1P83916 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX1P83916 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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