Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms