Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AIF1P55008 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AIF1P55008 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms