Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPAP53621 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPAP53621 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms