Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms