Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms