Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms