Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms