Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDSP20132 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDSP20132 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms