Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms