Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PGAM1P18669 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms