Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms