Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAV1P15498 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms