Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms