Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GLI4P10075 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GLI4P10075 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms