Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SPTA1P02549 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTA1P02549 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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