Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms